生物信息学
植物营养学术交流

利用Sublimetext 3搭建Python开发环境,并安装Biopython

1.首先安装python和相关的科学计算的包

Python 安装包在官网下载,选择适合自己电脑操作系统的版本,建议选择3.5,64位windows

下载链接:https://www.python.org/downloads/windows/

安装完成后打开cmd,按windows+x,点运行输入cmd,确定运行cmd,更新pip

输入:

python会自动卸载旧版pip,更新到最新版,网比较卡的时候可能会显示错误信息,多试几次就行。

在windows上可运行的与python科学计算、信息生物学有关的包都可以在这里找到:

http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

下载:

numpy scipy matplotlib biopython 四个包,然后用pip安装

安装代码示例:

也可以用cmd用cd命令一步一步进入文件目录,直接输入 pip install 文件名 安装

2.搭建sublimetext3的python开发环境

首先下载sublimetext,正版需要购买激活,可以去官网购买

绿化版下载链接:点我传送

这个绿化版有点小问题,按快捷键Ctrl+Shift+P,点击 Upgrade/Overwrite all packages,升级所有插件,等待片刻升级完插件控制台之后就可以安装任意插件了。

2.1安装SublimeREPL

Ctrl+shift+p 键入 install packages

稍等片刻后 键入 SublimeREPL 安装即可

通过选项Tools->SublimeREPL->Python就可以看到效果了

键位绑定后可通过快捷键从当前文档运行,或者运行python

打开Preferences(首选项)->Key Bindings(键位绑定)-User(用户),设置参数写法参考

key后面那个括号里面按键随便设,我的这个参考设置,alt+a是运行python,alt+z是运行当前编写的脚本。

ipython的热键设置方法

Python脚本运行后不退出的热键设置方法

2.2安装SublimeTmpl

Ctrl+shift+p 键入 install packages

稍等片刻后 键入SublimeTmpl安装即可

自定义模板路径: “Data\Packages\User\SublimeTmpl\templates” 目录, 会优先使用
默认模版路径: “Data\Packages\SublimeTmpl\templates” 目录.
用自己自定义的模板: 推荐把默认模版目录的*.tmpl文件 复制到 自定义模板路径, 再去修改.

模板参考:

按Ctrl+shift+alt+p直接新建python脚本。也可以从文件–>newfile(sublime tmpl)–>python 新建

2.2安装Python PEP8 Autoformat

Ctrl+shift+p 键入 install packages稍等片刻后 键入Python PEP8 Autoformat安装即可,默认热键Ctrl+shift+r,可以方便的将写好的代码转化成标准格式,在出现空格和tab键混用时报错时特别有效。

这样就可以写代码就很爽啦。

赞(3)
转载请联系:superxyz@qq.vip.com南农肥料网 » 利用Sublimetext 3搭建Python开发环境,并安装Biopython

评论 抢沙发

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址

南农肥料网,为您提供最贴心的服务

欢迎关注知乎主页欢迎关注github主页