生物信息学
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标签:python学习

不同分类级别的物种丰度t检测脚本-南农肥料网
python科学计算

不同分类级别的物种丰度t检测脚本

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在土壤细菌群落的研究中,有时我们也需要关注不同分类等级上物种序列丰度的差异。于是,我们根据这个思路,开发了不同分类层次下的序列丰度统计,差异检测,并分级聚类的脚本。 该Python脚本的思路是统计各分类层次下,各样本中包含的不同种类序列的数...

Qiime使用教程-南农肥料网
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Qiime使用教程

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Qiime微生生物基因组分析工具的安装 由于Qiime依赖的软件部分只有Linux的版本,Qiime官方建议Windows用户直接安装Qiime的Ubuntu虚拟机,本项研究采用的是1.9.1版本的Qiime。 首先下载并安装VirtuBo...

Biopython之多序列比对-南农肥料网
python科学计算

Biopython之多序列比对

xyz阅读(2780)评论(0)赞(2)

怎么说呢。 序列对比有很多工具都是很久以前大牛们就拿c语言写好的,直接拿来用就行了。本章的核心思想就是利用python的subprogress模块建立子程序调用这些对比工具。这些工具都需要自己先安装。安装方法写在注释里面了。 代码奉上。 [...

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