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生物信息学
植物营养学术交流

【今日观点】 拟南芥转录组分析

目录 1.准备工作 1.1.软件安装 1.2.数据下载 1.3.质控 2.序列比对 2.1.转录组测序序列和参考基因组的比对 2.2.提取编码蛋白的基因ID 2.3.将基因注释对应到比对出的序列上 3.结合实验处理进行下游分析 3.1.寻找...

土壤速效钾快速测定方法-南农肥料网
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土壤速效钾快速测定方法

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钾标准溶液配制 称取在110℃下烘干2h的KCl0.1907g定容到1L,制得100mg/L的钾标准溶液   乙酸铵溶液配制 称取77.08gNH4OAc定容到1L,用乙酸或者氨水调至pH7.0,制得1mol/L的乙酸铵溶液 &n...

不同分类级别的物种丰度t检测脚本-南农肥料网
python科学计算

不同分类级别的物种丰度t检测脚本

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在土壤细菌群落的研究中,有时我们也需要关注不同分类等级上物种序列丰度的差异。于是,我们根据这个思路,开发了不同分类层次下的序列丰度统计,差异检测,并分级聚类的脚本。 该Python脚本的思路是统计各分类层次下,各样本中包含的不同种类序列的数...

Qiime使用教程-南农肥料网
python科学计算

Qiime使用教程

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Qiime微生生物基因组分析工具的安装 由于Qiime依赖的软件部分只有Linux的版本,Qiime官方建议Windows用户直接安装Qiime的Ubuntu虚拟机,本项研究采用的是1.9.1版本的Qiime。 首先下载并安装VirtuBo...

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