生物信息学
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不同分类级别的物种丰度t检测脚本-南农肥料网

不同分类级别的物种丰度t检测脚本

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在土壤细菌群落的研究中,有时我们也需要关注不同分类等级上物种序列丰度的差异。于是,我们根据这个思路,开发了不同分类层次下的序列丰度统计,差异检测,并分级聚类的脚本。 该Python脚本的思路是统计各分类层次下,各样本中包含的不同种类序列的数...

Qiime使用教程-南农肥料网

Qiime使用教程

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Qiime微生生物基因组分析工具的安装 由于Qiime依赖的软件部分只有Linux的版本,Qiime官方建议Windows用户直接安装Qiime的Ubuntu虚拟机,本项研究采用的是1.9.1版本的Qiime。 首先下载并安装VirtuBo...

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